Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJB2P29033 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GJB2P29033 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJB2P29033 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJB2P29033 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJB2P29033 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJB2P29033 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJB2P29033 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJB2P29033 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJB2P29033 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJB2P29033 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJB2P29033 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GJB2P29033 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJB2P29033 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJB2P29033 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJB2P29033 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJB2P29033 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJB2P29033 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJB2P29033 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJB2P29033 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJB2P29033 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJB2P29033 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJB2P29033 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJB2P29033 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJB2P29033 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJB2P29033 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJB2P29033 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJB2P29033 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJB2P29033 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJB2P29033 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJB2P29033 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GJB2P29033 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJB2P29033 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJB2P29033 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJB2P29033 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJB2P29033 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GJB2P29033 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJB2P29033 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJB2P29033 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJB2P29033 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJB2P29033 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJB2P29033 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJB2P29033 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJB2P29033 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJB2P29033 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GJB2P29033 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GJB2P29033 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJB2P29033 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJB2P29033 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJB2P29033 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJB2P29033 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJB2P29033 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJB2P29033 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJB2P29033 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJB2P29033 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJB2P29033 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GJB2P29033 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJB2P29033 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GJB2P29033 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJB2P29033 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJB2P29033 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJB2P29033 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJB2P29033 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJB2P29033 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJB2P29033 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJB2P29033 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJB2P29033 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJB2P29033 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJB2P29033 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJB2P29033 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJB2P29033 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJB2P29033 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJB2P29033 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJB2P29033 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJB2P29033 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJB2P29033 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJB2P29033 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJB2P29033 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJB2P29033 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GJB2P29033 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJB2P29033 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJB2P29033 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GJB2P29033 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJB2P29033 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GJB2P29033 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJB2P29033 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJB2P29033 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJB2P29033 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJB2P29033 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJB2P29033 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJB2P29033 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJB2P29033 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJB2P29033 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJB2P29033 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJB2P29033 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJB2P29033 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJB2P29033 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJB2P29033 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJB2P29033 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GJB2P29033 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms