Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms