Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms