Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms