Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN1P18031 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN1P18031 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN1P18031 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN1P18031 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN1P18031 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN1P18031 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN1P18031 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN1P18031 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN1P18031 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN1P18031 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN1P18031 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN1P18031 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN1P18031 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN1P18031 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN1P18031 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN1P18031 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN1P18031 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN1P18031 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN1P18031 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN1P18031 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN1P18031 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN1P18031 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN1P18031 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN1P18031 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN1P18031 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN1P18031 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN1P18031 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN1P18031 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN1P18031 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN1P18031 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN1P18031 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN1P18031 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN1P18031 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN1P18031 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN1P18031 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN1P18031 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN1P18031 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN1P18031 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN1P18031 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN1P18031 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN1P18031 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN1P18031 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN1P18031 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN1P18031 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN1P18031 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN1P18031 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN1P18031 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN1P18031 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN1P18031 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN1P18031 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN1P18031 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN1P18031 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN1P18031 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN1P18031 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN1P18031 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN1P18031 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN1P18031 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN1P18031 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN1P18031 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN1P18031 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN1P18031 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN1P18031 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN1P18031 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN1P18031 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN1P18031 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN1P18031 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN1P18031 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN1P18031 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN1P18031 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN1P18031 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN1P18031 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN1P18031 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN1P18031 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN1P18031 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN1P18031 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN1P18031 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN1P18031 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN1P18031 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN1P18031 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN1P18031 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN1P18031 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN1P18031 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN1P18031 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN1P18031 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN1P18031 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN1P18031 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN1P18031 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN1P18031 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN1P18031 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN1P18031 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN1P18031 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN1P18031 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN1P18031 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN1P18031 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN1P18031 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN1P18031 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN1P18031 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN1P18031 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN1P18031 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms