Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms