Protein–RNA interactions for Protein: P14136

GFAP, Glial fibrillary acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFAPP14136 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFAPP14136 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFAPP14136 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFAPP14136 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFAPP14136 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFAPP14136 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFAPP14136 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFAPP14136 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFAPP14136 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFAPP14136 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFAPP14136 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFAPP14136 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFAPP14136 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GFAPP14136 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFAPP14136 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFAPP14136 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFAPP14136 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFAPP14136 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GFAPP14136 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFAPP14136 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFAPP14136 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFAPP14136 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFAPP14136 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFAPP14136 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFAPP14136 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFAPP14136 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFAPP14136 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFAPP14136 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFAPP14136 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFAPP14136 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFAPP14136 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFAPP14136 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFAPP14136 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFAPP14136 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFAPP14136 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFAPP14136 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFAPP14136 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFAPP14136 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFAPP14136 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFAPP14136 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFAPP14136 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFAPP14136 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFAPP14136 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFAPP14136 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFAPP14136 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFAPP14136 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFAPP14136 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFAPP14136 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFAPP14136 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFAPP14136 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFAPP14136 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFAPP14136 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFAPP14136 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFAPP14136 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFAPP14136 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFAPP14136 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFAPP14136 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFAPP14136 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFAPP14136 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFAPP14136 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFAPP14136 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFAPP14136 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GFAPP14136 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFAPP14136 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFAPP14136 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GFAPP14136 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFAPP14136 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GFAPP14136 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFAPP14136 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFAPP14136 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFAPP14136 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GFAPP14136 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFAPP14136 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFAPP14136 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFAPP14136 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFAPP14136 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GFAPP14136 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFAPP14136 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFAPP14136 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFAPP14136 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFAPP14136 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFAPP14136 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFAPP14136 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFAPP14136 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFAPP14136 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GFAPP14136 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFAPP14136 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFAPP14136 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFAPP14136 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFAPP14136 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFAPP14136 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFAPP14136 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFAPP14136 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFAPP14136 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFAPP14136 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFAPP14136 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GFAPP14136 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFAPP14136 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFAPP14136 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFAPP14136 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms