Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms