Protein–RNA interactions for Protein: P11802

CDK4, Cyclin-dependent kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK4P11802 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK4P11802 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK4P11802 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK4P11802 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK4P11802 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK4P11802 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK4P11802 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK4P11802 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK4P11802 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK4P11802 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK4P11802 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK4P11802 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK4P11802 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK4P11802 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK4P11802 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK4P11802 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK4P11802 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK4P11802 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK4P11802 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK4P11802 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK4P11802 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK4P11802 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK4P11802 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK4P11802 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK4P11802 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK4P11802 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK4P11802 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK4P11802 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK4P11802 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK4P11802 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK4P11802 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK4P11802 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK4P11802 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK4P11802 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK4P11802 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK4P11802 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK4P11802 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK4P11802 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK4P11802 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK4P11802 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK4P11802 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK4P11802 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK4P11802 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK4P11802 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK4P11802 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK4P11802 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK4P11802 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK4P11802 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK4P11802 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK4P11802 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK4P11802 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK4P11802 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK4P11802 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK4P11802 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK4P11802 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK4P11802 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK4P11802 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK4P11802 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK4P11802 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK4P11802 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK4P11802 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK4P11802 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK4P11802 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK4P11802 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK4P11802 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK4P11802 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK4P11802 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK4P11802 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK4P11802 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK4P11802 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK4P11802 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK4P11802 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK4P11802 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK4P11802 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK4P11802 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK4P11802 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK4P11802 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK4P11802 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK4P11802 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK4P11802 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK4P11802 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK4P11802 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK4P11802 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK4P11802 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK4P11802 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK4P11802 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK4P11802 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK4P11802 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK4P11802 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK4P11802 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK4P11802 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK4P11802 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK4P11802 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK4P11802 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK4P11802 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK4P11802 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK4P11802 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK4P11802 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK4P11802 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK4P11802 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms