Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
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