Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSLP07711 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSLP07711 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSLP07711 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSLP07711 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSLP07711 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSLP07711 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSLP07711 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSLP07711 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSLP07711 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSLP07711 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSLP07711 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSLP07711 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSLP07711 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSLP07711 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSLP07711 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSLP07711 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSLP07711 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSLP07711 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSLP07711 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSLP07711 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSLP07711 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSLP07711 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSLP07711 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSLP07711 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSLP07711 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSLP07711 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSLP07711 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSLP07711 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSLP07711 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSLP07711 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSLP07711 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSLP07711 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTSLP07711 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTSLP07711 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTSLP07711 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTSLP07711 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSLP07711 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSLP07711 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSLP07711 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSLP07711 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSLP07711 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSLP07711 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSLP07711 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSLP07711 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSLP07711 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSLP07711 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSLP07711 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSLP07711 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSLP07711 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSLP07711 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSLP07711 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSLP07711 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSLP07711 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSLP07711 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSLP07711 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSLP07711 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSLP07711 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSLP07711 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSLP07711 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSLP07711 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSLP07711 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSLP07711 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSLP07711 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSLP07711 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSLP07711 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSLP07711 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSLP07711 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSLP07711 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSLP07711 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSLP07711 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSLP07711 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSLP07711 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSLP07711 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSLP07711 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSLP07711 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSLP07711 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSLP07711 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSLP07711 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSLP07711 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSLP07711 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSLP07711 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSLP07711 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSLP07711 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSLP07711 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSLP07711 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSLP07711 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSLP07711 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSLP07711 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSLP07711 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSLP07711 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSLP07711 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSLP07711 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSLP07711 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSLP07711 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSLP07711 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSLP07711 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSLP07711 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSLP07711 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSLP07711 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms