Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYBBP04839 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CYBBP04839 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYBBP04839 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYBBP04839 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYBBP04839 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYBBP04839 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYBBP04839 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYBBP04839 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYBBP04839 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYBBP04839 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYBBP04839 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYBBP04839 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYBBP04839 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYBBP04839 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYBBP04839 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYBBP04839 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYBBP04839 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYBBP04839 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYBBP04839 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYBBP04839 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYBBP04839 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYBBP04839 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYBBP04839 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYBBP04839 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYBBP04839 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYBBP04839 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYBBP04839 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYBBP04839 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYBBP04839 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYBBP04839 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYBBP04839 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CYBBP04839 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYBBP04839 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CYBBP04839 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYBBP04839 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYBBP04839 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CYBBP04839 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CYBBP04839 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CYBBP04839 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CYBBP04839 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CYBBP04839 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYBBP04839 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYBBP04839 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYBBP04839 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYBBP04839 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYBBP04839 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYBBP04839 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYBBP04839 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYBBP04839 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYBBP04839 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYBBP04839 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYBBP04839 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYBBP04839 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYBBP04839 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYBBP04839 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYBBP04839 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYBBP04839 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYBBP04839 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYBBP04839 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYBBP04839 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYBBP04839 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYBBP04839 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYBBP04839 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYBBP04839 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYBBP04839 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYBBP04839 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYBBP04839 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYBBP04839 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYBBP04839 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYBBP04839 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYBBP04839 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYBBP04839 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYBBP04839 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYBBP04839 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYBBP04839 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYBBP04839 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CYBBP04839 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CYBBP04839 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYBBP04839 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYBBP04839 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYBBP04839 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CYBBP04839 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYBBP04839 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYBBP04839 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYBBP04839 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYBBP04839 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYBBP04839 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYBBP04839 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYBBP04839 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYBBP04839 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYBBP04839 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYBBP04839 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYBBP04839 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CYBBP04839 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYBBP04839 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYBBP04839 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYBBP04839 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYBBP04839 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYBBP04839 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms