Protein–RNA interactions for Protein: P01850

TRBC1, T-cell receptor beta-1 chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBC1P01850 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRBC1P01850 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRBC1P01850 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRBC1P01850 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRBC1P01850 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRBC1P01850 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRBC1P01850 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRBC1P01850 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRBC1P01850 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRBC1P01850 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRBC1P01850 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRBC1P01850 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRBC1P01850 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRBC1P01850 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRBC1P01850 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRBC1P01850 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRBC1P01850 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRBC1P01850 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRBC1P01850 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRBC1P01850 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRBC1P01850 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRBC1P01850 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRBC1P01850 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRBC1P01850 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRBC1P01850 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRBC1P01850 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRBC1P01850 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRBC1P01850 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRBC1P01850 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRBC1P01850 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRBC1P01850 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRBC1P01850 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRBC1P01850 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRBC1P01850 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRBC1P01850 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRBC1P01850 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRBC1P01850 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRBC1P01850 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRBC1P01850 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRBC1P01850 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRBC1P01850 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRBC1P01850 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRBC1P01850 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBC1P01850 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBC1P01850 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBC1P01850 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBC1P01850 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBC1P01850 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBC1P01850 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBC1P01850 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBC1P01850 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBC1P01850 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBC1P01850 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBC1P01850 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBC1P01850 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBC1P01850 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBC1P01850 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBC1P01850 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBC1P01850 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBC1P01850 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBC1P01850 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBC1P01850 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBC1P01850 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBC1P01850 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBC1P01850 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBC1P01850 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBC1P01850 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBC1P01850 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBC1P01850 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBC1P01850 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBC1P01850 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBC1P01850 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBC1P01850 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBC1P01850 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBC1P01850 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBC1P01850 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBC1P01850 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBC1P01850 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBC1P01850 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBC1P01850 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBC1P01850 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBC1P01850 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBC1P01850 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBC1P01850 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBC1P01850 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRBC1P01850 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRBC1P01850 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRBC1P01850 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRBC1P01850 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRBC1P01850 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRBC1P01850 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRBC1P01850 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRBC1P01850 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRBC1P01850 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRBC1P01850 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRBC1P01850 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRBC1P01850 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRBC1P01850 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRBC1P01850 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRBC1P01850 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms