Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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