Protein–RNA interactions for Protein: O95273

CCNDBP1, Cyclin-D1-binding protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1O95273 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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CCNDBP1O95273 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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CCNDBP1O95273 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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CCNDBP1O95273 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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CCNDBP1O95273 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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CCNDBP1O95273 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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CCNDBP1O95273 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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CCNDBP1O95273 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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CCNDBP1O95273 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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