Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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