Protein–RNA interactions for Protein: O43248

HOXC11, Homeobox protein Hox-C11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11O43248 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC11O43248 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC11O43248 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC11O43248 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC11O43248 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC11O43248 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC11O43248 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC11O43248 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC11O43248 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC11O43248 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC11O43248 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC11O43248 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC11O43248 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC11O43248 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC11O43248 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC11O43248 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC11O43248 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC11O43248 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC11O43248 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC11O43248 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC11O43248 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC11O43248 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC11O43248 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC11O43248 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC11O43248 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC11O43248 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC11O43248 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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HOXC11O43248 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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HOXC11O43248 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC11O43248 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC11O43248 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC11O43248 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC11O43248 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC11O43248 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC11O43248 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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HOXC11O43248 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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HOXC11O43248 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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HOXC11O43248 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
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HOXC11O43248 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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HOXC11O43248 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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HOXC11O43248 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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HOXC11O43248 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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HOXC11O43248 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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HOXC11O43248 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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HOXC11O43248 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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