Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

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Length 1,565 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNMO15061 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNMO15061 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNMO15061 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNMO15061 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNMO15061 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNMO15061 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNMO15061 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNMO15061 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNMO15061 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNMO15061 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNMO15061 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNMO15061 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNMO15061 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNMO15061 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNMO15061 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNMO15061 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNMO15061 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNMO15061 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNMO15061 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNMO15061 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNMO15061 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNMO15061 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNMO15061 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNMO15061 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNMO15061 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNMO15061 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNMO15061 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNMO15061 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNMO15061 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNMO15061 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNMO15061 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNMO15061 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNMO15061 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNMO15061 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNMO15061 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNMO15061 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNMO15061 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNMO15061 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNMO15061 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNMO15061 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNMO15061 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNMO15061 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNMO15061 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNMO15061 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNMO15061 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNMO15061 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNMO15061 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNMO15061 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNMO15061 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNMO15061 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNMO15061 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNMO15061 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNMO15061 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNMO15061 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNMO15061 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNMO15061 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNMO15061 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNMO15061 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNMO15061 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNMO15061 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNMO15061 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNMO15061 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNMO15061 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNMO15061 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNMO15061 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNMO15061 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNMO15061 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNMO15061 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNMO15061 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNMO15061 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNMO15061 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNMO15061 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNMO15061 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNMO15061 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNMO15061 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNMO15061 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNMO15061 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNMO15061 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNMO15061 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNMO15061 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNMO15061 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNMO15061 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNMO15061 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNMO15061 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNMO15061 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNMO15061 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNMO15061 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNMO15061 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNMO15061 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNMO15061 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNMO15061 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNMO15061 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNMO15061 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNMO15061 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNMO15061 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNMO15061 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNMO15061 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNMO15061 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNMO15061 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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