Protein–RNA interactions for Protein: A6NIR3

AGAP5, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP5A6NIR3 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms