Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms