Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

BIVM-ERCC5, BIVM-ERCC5 readthrough, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
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