Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.3 ms