Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RABGEF1Q9UJ41 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RABGEF1Q9UJ41 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RABGEF1Q9UJ41 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RABGEF1Q9UJ41 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RABGEF1Q9UJ41 LRRIQ3-202ENST00000370909 793 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RABGEF1Q9UJ41 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RABGEF1Q9UJ41 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RABGEF1Q9UJ41 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RABGEF1Q9UJ41 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RABGEF1Q9UJ41 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RABGEF1Q9UJ41 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RABGEF1Q9UJ41 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RABGEF1Q9UJ41 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RABGEF1Q9UJ41 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RABGEF1Q9UJ41 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RABGEF1Q9UJ41 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RABGEF1Q9UJ41 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RABGEF1Q9UJ41 AC092131.1-201ENST00000564046 548 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RABGEF1Q9UJ41 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RABGEF1Q9UJ41 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RABGEF1Q9UJ41 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RABGEF1Q9UJ41 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RABGEF1Q9UJ41 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RABGEF1Q9UJ41 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RABGEF1Q9UJ41 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RABGEF1Q9UJ41 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RABGEF1Q9UJ41 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RABGEF1Q9UJ41 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RABGEF1Q9UJ41 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RABGEF1Q9UJ41 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RABGEF1Q9UJ41 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RABGEF1Q9UJ41 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RABGEF1Q9UJ41 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RABGEF1Q9UJ41 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RABGEF1Q9UJ41 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RABGEF1Q9UJ41 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RABGEF1Q9UJ41 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RABGEF1Q9UJ41 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms