Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms