Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 909.1 ms