Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC21■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms