Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms