Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR2

LRP1B, Low-density lipoprotein receptor-related protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 4,599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1BQ9NZR2 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LRP1BQ9NZR2 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LRP1BQ9NZR2 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LRP1BQ9NZR2 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LRP1BQ9NZR2 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LRP1BQ9NZR2 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LRP1BQ9NZR2 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LRP1BQ9NZR2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LRP1BQ9NZR2 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LRP1BQ9NZR2 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
LRP1BQ9NZR2 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LRP1BQ9NZR2 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
LRP1BQ9NZR2 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
LRP1BQ9NZR2 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LRP1BQ9NZR2 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LRP1BQ9NZR2 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
LRP1BQ9NZR2 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LRP1BQ9NZR2 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LRP1BQ9NZR2 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LRP1BQ9NZR2 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LRP1BQ9NZR2 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
LRP1BQ9NZR2 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LRP1BQ9NZR2 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1BQ9NZR2 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1BQ9NZR2 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1BQ9NZR2 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1BQ9NZR2 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1BQ9NZR2 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1BQ9NZR2 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1BQ9NZR2 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1BQ9NZR2 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1BQ9NZR2 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1BQ9NZR2 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1BQ9NZR2 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1BQ9NZR2 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1BQ9NZR2 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1BQ9NZR2 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1BQ9NZR2 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1BQ9NZR2 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1BQ9NZR2 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1BQ9NZR2 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1BQ9NZR2 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1BQ9NZR2 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1BQ9NZR2 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1BQ9NZR2 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1BQ9NZR2 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1BQ9NZR2 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1BQ9NZR2 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1BQ9NZR2 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1BQ9NZR2 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1BQ9NZR2 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1BQ9NZR2 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1BQ9NZR2 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1BQ9NZR2 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1BQ9NZR2 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1BQ9NZR2 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1BQ9NZR2 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1BQ9NZR2 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1BQ9NZR2 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1BQ9NZR2 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1BQ9NZR2 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1BQ9NZR2 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1BQ9NZR2 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1BQ9NZR2 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1BQ9NZR2 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1BQ9NZR2 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1BQ9NZR2 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1BQ9NZR2 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1BQ9NZR2 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1BQ9NZR2 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1BQ9NZR2 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1BQ9NZR2 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1BQ9NZR2 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1BQ9NZR2 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1BQ9NZR2 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1BQ9NZR2 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1BQ9NZR2 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1BQ9NZR2 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1BQ9NZR2 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1BQ9NZR2 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1BQ9NZR2 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1BQ9NZR2 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1BQ9NZR2 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1BQ9NZR2 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1BQ9NZR2 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1BQ9NZR2 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1BQ9NZR2 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1BQ9NZR2 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1BQ9NZR2 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1BQ9NZR2 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1BQ9NZR2 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1BQ9NZR2 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1BQ9NZR2 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
LRP1BQ9NZR2 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
LRP1BQ9NZR2 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
LRP1BQ9NZR2 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
LRP1BQ9NZR2 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
LRP1BQ9NZR2 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
LRP1BQ9NZR2 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
LRP1BQ9NZR2 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms