Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB4

KRT82, Keratin, type II cuticular Hb2, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT82Q9NSB4 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRT82Q9NSB4 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRT82Q9NSB4 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT82Q9NSB4 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT82Q9NSB4 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT82Q9NSB4 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT82Q9NSB4 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT82Q9NSB4 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT82Q9NSB4 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT82Q9NSB4 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT82Q9NSB4 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT82Q9NSB4 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT82Q9NSB4 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT82Q9NSB4 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT82Q9NSB4 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT82Q9NSB4 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT82Q9NSB4 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT82Q9NSB4 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT82Q9NSB4 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT82Q9NSB4 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT82Q9NSB4 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT82Q9NSB4 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT82Q9NSB4 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT82Q9NSB4 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT82Q9NSB4 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT82Q9NSB4 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT82Q9NSB4 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT82Q9NSB4 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT82Q9NSB4 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT82Q9NSB4 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT82Q9NSB4 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT82Q9NSB4 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT82Q9NSB4 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KRT82Q9NSB4 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KRT82Q9NSB4 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KRT82Q9NSB4 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KRT82Q9NSB4 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KRT82Q9NSB4 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT82Q9NSB4 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT82Q9NSB4 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT82Q9NSB4 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT82Q9NSB4 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT82Q9NSB4 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT82Q9NSB4 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT82Q9NSB4 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT82Q9NSB4 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT82Q9NSB4 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT82Q9NSB4 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT82Q9NSB4 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT82Q9NSB4 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT82Q9NSB4 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT82Q9NSB4 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT82Q9NSB4 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT82Q9NSB4 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT82Q9NSB4 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT82Q9NSB4 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT82Q9NSB4 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT82Q9NSB4 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT82Q9NSB4 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT82Q9NSB4 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT82Q9NSB4 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT82Q9NSB4 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT82Q9NSB4 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT82Q9NSB4 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT82Q9NSB4 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT82Q9NSB4 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT82Q9NSB4 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT82Q9NSB4 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT82Q9NSB4 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT82Q9NSB4 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT82Q9NSB4 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT82Q9NSB4 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT82Q9NSB4 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT82Q9NSB4 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT82Q9NSB4 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT82Q9NSB4 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT82Q9NSB4 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT82Q9NSB4 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT82Q9NSB4 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT82Q9NSB4 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT82Q9NSB4 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT82Q9NSB4 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT82Q9NSB4 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT82Q9NSB4 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT82Q9NSB4 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT82Q9NSB4 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT82Q9NSB4 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT82Q9NSB4 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT82Q9NSB4 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT82Q9NSB4 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT82Q9NSB4 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT82Q9NSB4 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT82Q9NSB4 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT82Q9NSB4 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT82Q9NSB4 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT82Q9NSB4 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT82Q9NSB4 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT82Q9NSB4 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT82Q9NSB4 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT82Q9NSB4 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms