Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SERINC1Q9NRX5 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SERINC1Q9NRX5 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
SERINC1Q9NRX5 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
SERINC1Q9NRX5 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SERINC1Q9NRX5 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SERINC1Q9NRX5 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SERINC1Q9NRX5 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SERINC1Q9NRX5 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
SERINC1Q9NRX5 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SERINC1Q9NRX5 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SERINC1Q9NRX5 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SERINC1Q9NRX5 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SERINC1Q9NRX5 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SERINC1Q9NRX5 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SERINC1Q9NRX5 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SERINC1Q9NRX5 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SERINC1Q9NRX5 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SERINC1Q9NRX5 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SERINC1Q9NRX5 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SERINC1Q9NRX5 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SERINC1Q9NRX5 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SERINC1Q9NRX5 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SERINC1Q9NRX5 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SERINC1Q9NRX5 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SERINC1Q9NRX5 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SERINC1Q9NRX5 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SERINC1Q9NRX5 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SERINC1Q9NRX5 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SERINC1Q9NRX5 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SERINC1Q9NRX5 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SERINC1Q9NRX5 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SERINC1Q9NRX5 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SERINC1Q9NRX5 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SERINC1Q9NRX5 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SERINC1Q9NRX5 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SERINC1Q9NRX5 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SERINC1Q9NRX5 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SERINC1Q9NRX5 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SERINC1Q9NRX5 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SERINC1Q9NRX5 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SERINC1Q9NRX5 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SERINC1Q9NRX5 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SERINC1Q9NRX5 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SERINC1Q9NRX5 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SERINC1Q9NRX5 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SERINC1Q9NRX5 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SERINC1Q9NRX5 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SERINC1Q9NRX5 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SERINC1Q9NRX5 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SERINC1Q9NRX5 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SERINC1Q9NRX5 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SERINC1Q9NRX5 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SERINC1Q9NRX5 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SERINC1Q9NRX5 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SERINC1Q9NRX5 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SERINC1Q9NRX5 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SERINC1Q9NRX5 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SERINC1Q9NRX5 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SERINC1Q9NRX5 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SERINC1Q9NRX5 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SERINC1Q9NRX5 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SERINC1Q9NRX5 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SERINC1Q9NRX5 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SERINC1Q9NRX5 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SERINC1Q9NRX5 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SERINC1Q9NRX5 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SERINC1Q9NRX5 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SERINC1Q9NRX5 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SERINC1Q9NRX5 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SERINC1Q9NRX5 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SERINC1Q9NRX5 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SERINC1Q9NRX5 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SERINC1Q9NRX5 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SERINC1Q9NRX5 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SERINC1Q9NRX5 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SERINC1Q9NRX5 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SERINC1Q9NRX5 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SERINC1Q9NRX5 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SERINC1Q9NRX5 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SERINC1Q9NRX5 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SERINC1Q9NRX5 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
SERINC1Q9NRX5 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SERINC1Q9NRX5 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SERINC1Q9NRX5 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SERINC1Q9NRX5 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SERINC1Q9NRX5 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SERINC1Q9NRX5 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SERINC1Q9NRX5 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SERINC1Q9NRX5 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SERINC1Q9NRX5 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
SERINC1Q9NRX5 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
SERINC1Q9NRX5 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
SERINC1Q9NRX5 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SERINC1Q9NRX5 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SERINC1Q9NRX5 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SERINC1Q9NRX5 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SERINC1Q9NRX5 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SERINC1Q9NRX5 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SERINC1Q9NRX5 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms