Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms