Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

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Length 1,115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PTPRHQ9HD43 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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PTPRHQ9HD43 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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PTPRHQ9HD43 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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PTPRHQ9HD43 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
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PTPRHQ9HD43 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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PTPRHQ9HD43 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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PTPRHQ9HD43 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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PTPRHQ9HD43 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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