Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN0

GPR88, Probable G-protein coupled receptor 88, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR88Q9GZN0 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR88Q9GZN0 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR88Q9GZN0 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR88Q9GZN0 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR88Q9GZN0 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR88Q9GZN0 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR88Q9GZN0 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR88Q9GZN0 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR88Q9GZN0 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR88Q9GZN0 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR88Q9GZN0 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR88Q9GZN0 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR88Q9GZN0 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR88Q9GZN0 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR88Q9GZN0 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR88Q9GZN0 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR88Q9GZN0 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR88Q9GZN0 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR88Q9GZN0 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR88Q9GZN0 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR88Q9GZN0 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR88Q9GZN0 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR88Q9GZN0 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR88Q9GZN0 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR88Q9GZN0 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR88Q9GZN0 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR88Q9GZN0 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR88Q9GZN0 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR88Q9GZN0 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR88Q9GZN0 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR88Q9GZN0 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR88Q9GZN0 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR88Q9GZN0 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR88Q9GZN0 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR88Q9GZN0 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR88Q9GZN0 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR88Q9GZN0 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR88Q9GZN0 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPR88Q9GZN0 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPR88Q9GZN0 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPR88Q9GZN0 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPR88Q9GZN0 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPR88Q9GZN0 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPR88Q9GZN0 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPR88Q9GZN0 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPR88Q9GZN0 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPR88Q9GZN0 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPR88Q9GZN0 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPR88Q9GZN0 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPR88Q9GZN0 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPR88Q9GZN0 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPR88Q9GZN0 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPR88Q9GZN0 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPR88Q9GZN0 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPR88Q9GZN0 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPR88Q9GZN0 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPR88Q9GZN0 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPR88Q9GZN0 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPR88Q9GZN0 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPR88Q9GZN0 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPR88Q9GZN0 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPR88Q9GZN0 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPR88Q9GZN0 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPR88Q9GZN0 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPR88Q9GZN0 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GPR88Q9GZN0 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPR88Q9GZN0 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPR88Q9GZN0 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GPR88Q9GZN0 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPR88Q9GZN0 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPR88Q9GZN0 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPR88Q9GZN0 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GPR88Q9GZN0 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GPR88Q9GZN0 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GPR88Q9GZN0 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GPR88Q9GZN0 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GPR88Q9GZN0 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GPR88Q9GZN0 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GPR88Q9GZN0 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GPR88Q9GZN0 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GPR88Q9GZN0 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GPR88Q9GZN0 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GPR88Q9GZN0 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GPR88Q9GZN0 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GPR88Q9GZN0 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GPR88Q9GZN0 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GPR88Q9GZN0 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GPR88Q9GZN0 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPR88Q9GZN0 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPR88Q9GZN0 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPR88Q9GZN0 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPR88Q9GZN0 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPR88Q9GZN0 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPR88Q9GZN0 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPR88Q9GZN0 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPR88Q9GZN0 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPR88Q9GZN0 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPR88Q9GZN0 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPR88Q9GZN0 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPR88Q9GZN0 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms