Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR6

KRTAP3-3, Keratin-associated protein 3-3, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP3-3Q9BYR6 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP3-3Q9BYR6 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP3-3Q9BYR6 TMEM97-202ENST00000336687 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP3-3Q9BYR6 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP3-3Q9BYR6 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP3-3Q9BYR6 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP3-3Q9BYR6 DBT-201ENST00000370131 1521 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP3-3Q9BYR6 NLK-203ENST00000582037 1503 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP3-3Q9BYR6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP3-3Q9BYR6 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP3-3Q9BYR6 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP3-3Q9BYR6 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP3-3Q9BYR6 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP3-3Q9BYR6 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP3-3Q9BYR6 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP3-3Q9BYR6 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP3-3Q9BYR6 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP3-3Q9BYR6 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP3-3Q9BYR6 LINC00641-202ENST00000555688 1763 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP3-3Q9BYR6 GNG4-201ENST00000366597 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP3-3Q9BYR6 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP3-3Q9BYR6 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP3-3Q9BYR6 AC131212.2-201ENST00000622917 1355 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP3-3Q9BYR6 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP3-3Q9BYR6 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-3Q9BYR6 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-3Q9BYR6 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-3Q9BYR6 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-3Q9BYR6 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-3Q9BYR6 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-3Q9BYR6 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-3Q9BYR6 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-3Q9BYR6 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-3Q9BYR6 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-3Q9BYR6 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-3Q9BYR6 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-3Q9BYR6 AC010201.2-201ENST00000605595 1495 ntBASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-3Q9BYR6 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-3Q9BYR6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-3Q9BYR6 DEFB103A-201ENST00000314357 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-3Q9BYR6 DEFB103B-201ENST00000318124 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-3Q9BYR6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-3Q9BYR6 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-3Q9BYR6 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-3Q9BYR6 SPACA5-202ENST00000376940 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-3Q9BYR6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-3Q9BYR6 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-3Q9BYR6 RPL36A-202ENST00000392994 691 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-3Q9BYR6 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-3Q9BYR6 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-3Q9BYR6 KDM5C-IT1-201ENST00000412242 755 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-3Q9BYR6 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-3Q9BYR6 ARHGEF9-IT1-201ENST00000420917 394 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-3Q9BYR6 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-3Q9BYR6 AL606534.4-201ENST00000427176 792 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-3Q9BYR6 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-3Q9BYR6 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-3Q9BYR6 LINC01133-202ENST00000443364 1266 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-3Q9BYR6 LINC00332-201ENST00000455241 834 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-3Q9BYR6 AC108025.2-201ENST00000455579 1199 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-3Q9BYR6 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-3Q9BYR6 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-3Q9BYR6 AC087664.1-201ENST00000521456 358 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-3Q9BYR6 AC008415.1-201ENST00000522189 734 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-3Q9BYR6 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-3Q9BYR6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-3Q9BYR6 OR56A7P-201ENST00000524865 941 ntBASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-3Q9BYR6 C11orf70-205ENST00000534360 520 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-3Q9BYR6 AL132777.1-201ENST00000556153 618 ntBASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-3Q9BYR6 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-3Q9BYR6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-3Q9BYR6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-3Q9BYR6 AC005154.1-230ENST00000578994 644 ntTSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-3Q9BYR6 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-3Q9BYR6 RN7SL237P-201ENST00000580912 287 ntBASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-3Q9BYR6 AC015911.2-201ENST00000585536 396 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-3Q9BYR6 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-3Q9BYR6 AC007786.1-202ENST00000590607 443 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-3Q9BYR6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-3Q9BYR6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-3Q9BYR6 AL078624.1-201ENST00000604004 547 ntBASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-3Q9BYR6 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-3Q9BYR6 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-3Q9BYR6 AL034428.1-202ENST00000613736 625 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-3Q9BYR6 AC092683.2-203ENST00000618807 788 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-3Q9BYR6 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-3Q9BYR6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-3Q9BYR6 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-3Q9BYR6 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-3Q9BYR6 LINC00643-207ENST00000637212 734 ntBASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-3Q9BYR6 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-3Q9BYR6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-3Q9BYR6 UGT2B28-202ENST00000511240 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-3Q9BYR6 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-3Q9BYR6 OR4K16P-202ENST00000641135 1506 ntBASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-3Q9BYR6 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-3Q9BYR6 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-3Q9BYR6 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-3Q9BYR6 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-3Q9BYR6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 428.1 ms