Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms