Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms