Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRACR2AQ9BSW2 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRACR2AQ9BSW2 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CRACR2AQ9BSW2 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRACR2AQ9BSW2 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRACR2AQ9BSW2 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRACR2AQ9BSW2 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRACR2AQ9BSW2 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRACR2AQ9BSW2 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRACR2AQ9BSW2 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms