Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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