Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms