Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms