Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms