Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms