Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX21Q969T3 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX21Q969T3 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX21Q969T3 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX21Q969T3 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX21Q969T3 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX21Q969T3 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX21Q969T3 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX21Q969T3 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX21Q969T3 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX21Q969T3 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX21Q969T3 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX21Q969T3 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX21Q969T3 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX21Q969T3 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX21Q969T3 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX21Q969T3 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX21Q969T3 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX21Q969T3 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX21Q969T3 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX21Q969T3 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX21Q969T3 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX21Q969T3 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX21Q969T3 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX21Q969T3 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX21Q969T3 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX21Q969T3 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX21Q969T3 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX21Q969T3 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX21Q969T3 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX21Q969T3 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX21Q969T3 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX21Q969T3 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX21Q969T3 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX21Q969T3 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX21Q969T3 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX21Q969T3 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX21Q969T3 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX21Q969T3 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX21Q969T3 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX21Q969T3 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX21Q969T3 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX21Q969T3 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX21Q969T3 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX21Q969T3 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX21Q969T3 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX21Q969T3 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX21Q969T3 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX21Q969T3 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX21Q969T3 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX21Q969T3 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX21Q969T3 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX21Q969T3 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX21Q969T3 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX21Q969T3 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX21Q969T3 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX21Q969T3 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX21Q969T3 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX21Q969T3 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX21Q969T3 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX21Q969T3 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX21Q969T3 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX21Q969T3 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX21Q969T3 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX21Q969T3 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX21Q969T3 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX21Q969T3 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX21Q969T3 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX21Q969T3 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX21Q969T3 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX21Q969T3 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX21Q969T3 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX21Q969T3 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX21Q969T3 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX21Q969T3 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX21Q969T3 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX21Q969T3 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX21Q969T3 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX21Q969T3 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX21Q969T3 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX21Q969T3 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX21Q969T3 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX21Q969T3 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX21Q969T3 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX21Q969T3 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX21Q969T3 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX21Q969T3 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX21Q969T3 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX21Q969T3 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX21Q969T3 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX21Q969T3 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX21Q969T3 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX21Q969T3 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX21Q969T3 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX21Q969T3 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX21Q969T3 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX21Q969T3 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX21Q969T3 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX21Q969T3 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX21Q969T3 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms