Protein–RNA interactions for Protein: Q969E2

SCAMP4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4Q969E2 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms