Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms