Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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