Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVY7

UBLCP1, Ubiquitin-like domain-containing CTD phosphatase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBLCP1Q8WVY7 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBLCP1Q8WVY7 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBLCP1Q8WVY7 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
UBLCP1Q8WVY7 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBLCP1Q8WVY7 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBLCP1Q8WVY7 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBLCP1Q8WVY7 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBLCP1Q8WVY7 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBLCP1Q8WVY7 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBLCP1Q8WVY7 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBLCP1Q8WVY7 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBLCP1Q8WVY7 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBLCP1Q8WVY7 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBLCP1Q8WVY7 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBLCP1Q8WVY7 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBLCP1Q8WVY7 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBLCP1Q8WVY7 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBLCP1Q8WVY7 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBLCP1Q8WVY7 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBLCP1Q8WVY7 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBLCP1Q8WVY7 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBLCP1Q8WVY7 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBLCP1Q8WVY7 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBLCP1Q8WVY7 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBLCP1Q8WVY7 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBLCP1Q8WVY7 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBLCP1Q8WVY7 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBLCP1Q8WVY7 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBLCP1Q8WVY7 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBLCP1Q8WVY7 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBLCP1Q8WVY7 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBLCP1Q8WVY7 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBLCP1Q8WVY7 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBLCP1Q8WVY7 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBLCP1Q8WVY7 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBLCP1Q8WVY7 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBLCP1Q8WVY7 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBLCP1Q8WVY7 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBLCP1Q8WVY7 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBLCP1Q8WVY7 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBLCP1Q8WVY7 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBLCP1Q8WVY7 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBLCP1Q8WVY7 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBLCP1Q8WVY7 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBLCP1Q8WVY7 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBLCP1Q8WVY7 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBLCP1Q8WVY7 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBLCP1Q8WVY7 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBLCP1Q8WVY7 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBLCP1Q8WVY7 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBLCP1Q8WVY7 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBLCP1Q8WVY7 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBLCP1Q8WVY7 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBLCP1Q8WVY7 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBLCP1Q8WVY7 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBLCP1Q8WVY7 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBLCP1Q8WVY7 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBLCP1Q8WVY7 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBLCP1Q8WVY7 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBLCP1Q8WVY7 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
UBLCP1Q8WVY7 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBLCP1Q8WVY7 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBLCP1Q8WVY7 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBLCP1Q8WVY7 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBLCP1Q8WVY7 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBLCP1Q8WVY7 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
UBLCP1Q8WVY7 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBLCP1Q8WVY7 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBLCP1Q8WVY7 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBLCP1Q8WVY7 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBLCP1Q8WVY7 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
UBLCP1Q8WVY7 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBLCP1Q8WVY7 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBLCP1Q8WVY7 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBLCP1Q8WVY7 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBLCP1Q8WVY7 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBLCP1Q8WVY7 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBLCP1Q8WVY7 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBLCP1Q8WVY7 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBLCP1Q8WVY7 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBLCP1Q8WVY7 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
UBLCP1Q8WVY7 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
UBLCP1Q8WVY7 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBLCP1Q8WVY7 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBLCP1Q8WVY7 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBLCP1Q8WVY7 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBLCP1Q8WVY7 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBLCP1Q8WVY7 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBLCP1Q8WVY7 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBLCP1Q8WVY7 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBLCP1Q8WVY7 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBLCP1Q8WVY7 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBLCP1Q8WVY7 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBLCP1Q8WVY7 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBLCP1Q8WVY7 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBLCP1Q8WVY7 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBLCP1Q8WVY7 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
UBLCP1Q8WVY7 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBLCP1Q8WVY7 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBLCP1Q8WVY7 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms