Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms