Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms