Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXF0

NPAS3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3Q8IXF0 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms